Package: libvcflib1 (1.0.2+dfsg-2)

[ Source: libvcflib  ]

libreria C++ per analizzare e manipolare file VCF

Variant Call Format (VCF) è un formato testuale semplice delimitato da tabulazioni pensato per descrivere in modo conciso variazioni tra individui indicizzate rispetto ad un riferimento. VCF fornisce un formato comune di interscambio per la descrizione di variazioni in individui e popolazioni di campioni, ed è diventato il formato standard di fatto per i rapporti per una vasta gamma di rilevatori di varianti genomiche.

vcflib fornisce metodi per manipolare ed interpretare variazioni di sequenza come possono essere descritte da VCF. È:

 * un'API per analizzare e lavorare su record di variazioni genomiche
   come possono essere descritte dal formato VCF;
 * una raccolta di utilità a riga di comando per eseguire manipolazioni
   complesse di file VCF.

Tags: Role: Shared Library

Other Packages Related to libvcflib1

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  libreria per la misura dell'entropia di flussi di byte

• dep: libfastahack0 (>= 1.0.0+dfsg)

  libreria per indicizzare ed estrarre sequenze da file FASTA (libreria)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  determina regioni simili tra due stringhe o sequenze genomiche (libreria)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

Download libvcflib1

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
armel	133.1 kB	388.0 kB	[list of files]