[ Source: seqtools ]
Package: belvu (4.44.1+dfsg-6 and others)
Links for belvu
Debian Resources:
Download Source Package seqtools:
- [seqtools_4.44.1+dfsg-6.dsc]
- [seqtools_4.44.1+dfsg.orig.tar.xz]
- [seqtools_4.44.1+dfsg-6.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [www.sanger.ac.uk]
Similar packages:
visualizzatore di allineamenti multipli di sequenze e strumento filogenetico
Belvu è un visualizzatore di allineamenti multipli di sequenze e strumento filogenetico con un esteso insieme di modalità configurabili dall'utente per colorare i residui.
* Visualizza allineamenti multipli di sequenze. * I residui possono essere colorati per conservazione, con soglia e colori configurabili dall'utente. * I residui possono essere colorati per tipo di residuo (configurabile dall'utente. * Gli schemi dei colori possono essere importati o esportati. * Le voci Swissprot (o PIR) possono essere recuperate tramite doppio clic. * La posizione nell'allineamento può essere facilmente tracciata. * Eliminazione manuale di righe e colonne. * Modifica automatica di righe e colonne sulla base di criteri personalizzabili: - rimozione di colonne con soli gap; - rimozione di tutti i gap; - rimozione di sequenze ridondanti; - rimozione di una colonna in base a una percentuale di gap specificata dall'utente; - filtraggio di sequenze in base a una percentuale di identicità; - rimozione di sequenze in base a una percentuale di gap specificata dall'utente; - rimozione di sequenze parziali (quelle che iniziano o finiscono con gap); - rimozione di colonne per conservazione (con soglia superiore e inferiore specificate dall'utente). * L'allineamento può essere salvato nei formati Stockholm, Selex, MSF o FASTA. * Le matrici di distanza tra sequenze possono essere generate usando svariate metriche di distanza. * Le matrici di distanza possono essere importate o esportate. * Gli alberi filogenetici possono essere costruiti sulla base di svariati algoritmi di ricostruzione dell'albero basati sulla distanza. * Gli alberi possono essere salvati nel formato New Hampshire. * Belvu può eseguire la ricostruzione filogenetica bootstrap.
Other Packages Related to belvu
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libcairo2 (>= 1.2.4)
- libreria Cairo per grafica 2D vettoriale
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- dep: libcurl4 (>= 7.16.2)
- libreria lato client facile da usare per il trasferimento di URL (versione OpenSSL)
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- dep: libgbtools0 (>= 4.44.1+dfsg)
- libreria per visualizzare allineamenti di sequenze
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.5)
- libreria di supporto a GCC
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- dep: libglib2.0-0 (>= 2.22.0)
- libreria GLib di routine in C
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- dep: libgtk2.0-0 (>= 2.12.0)
- libreria per interfacce utente grafiche GTK - vecchia versione
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- dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)
- impaginazione e rendering di testo internazionalizzato
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- dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
Download belvu
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
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armel | 4.44.1+dfsg-6+b1 | 1,015.3 kB | 1,194.0 kB | [list of files] |