Package: zalign (0.9.1-5)

[ Source: zalign  ]

allineamento locale parallelo di sequenze biologiche

zAlign è un allineatore di sequenze locali, specificamente pensato per l'uso con grandi sequenze biologiche di DNA, con più di 1Mbp (milioni di paia di basi). Per svolgere questo compito usa l'algoritmo esatto di Smith-Waterman con la funzione di costo affine per i gap.

zAlign può essere usato sia in ambienti distribuiti (cluster, per esempio) sia autonomi. Al momento è stato collaudato su Linux e Sun Solaris, usando entrambe le implementazioni MPICH (http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/mpich1/) e OpenMPI (http://www.open-mpi.org/). C'è un grande interesse per i port per gli altri ambienti simil-Unix.

Other Packages Related to zalign

• dep: libc6 (>= 2.17)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)

  libreria per il passaggio di messaggi dalle alte prestazioni - libreria condivisa

• dep: libstdc++6 (>= 4.9)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
arm64	45.1 kB	263.0 kB	[list of files]