Package: fastqc (0.11.9+dfsg-4)
Links for fastqc
Debian Resources:
Download Source Package fastqc:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Olivier Sallou (QA Page)
External Resources:
- Homepage [www.bioinformatics.babraham.ac.uk]
Similar packages:
controllo di qualità per elevati flussi di dati di sequenze
FastQC mira a fornire un metodo rapido per effettuare alcuni controlli di qualità su elevati flussi attraverso pipe di dati di sequenze grezzi. Fornisce un insieme modulare di analisi che consentono di avere una veloce panoramica sui dati per individuare eventuali presenze di errori o problemi che bisogna tenere in considerazione prima di utilizzarli in analisi successive.
Le funzioni principali di FastQC sono:
* importazione di dati da file BAM, SAM o FastQ (qualsiasi variante); * rapida panoramica per identificare in quali aree potrebbero esserci problemi; * grafici e tabelle riepilogative per una valutazione rapida dei dati; * esportazione dei risultati in un report permanente in formato HTML; * modalità offline che consente la generazione di report automatici senza eseguire l'applicazione interattiva.
Other Packages Related to fastqc
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- dep: default-jre
- runtime Java standard o compatibile
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- dep: libcommons-math3-java
- componenti Java leggeri per matematica e statistica
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- dep: libfindbin-libs-perl
- Perl module to use a relative path for lib directories
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- dep: libhtsjdk-java
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- dep: libjbzip2-java
- libreria per compressione/decompressione bzip2
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- dep: libsis-jhdf5-java
- libreria HDF facile da usare per Java
Download fastqc
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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all | 380.6 kB | 564.0 kB | [list of files] |