Package: r-bioc-rtracklayer (1.50.0-1)

[ Source: r-bioc-rtracklayer  ]

interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione

Infrastruttura estensibile per interagire con più navigatori di genomi (attualmente incorporato UCSC) e manipolare tracce di annotazioni in vari formati (attualmente incorporati GFF, BED, bedGraph, BED15, WIG, BigWig e 2bit). L'utente può esportare e importare tracce verso e dai navigatori gestiti, così come interrogare e modificare lo stato del navigatore, come l'attuale porzione visualizzata.

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• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2)

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• sug: r-bioc-bsgenome (>= 1.33.4)

  infrastruttura BioConductor per pacchetti di dati genomici basati su Biostrings

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• sug: r-bioc-limma

  modelli lineari per dati di microarray

• sug: r-bioc-org.hs.eg.db

  annotazioni a livello di tutto genoma per l'Uomo

• sug: r-cran-runit

  pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unità

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