Package: q2-quality-filter (2020.11.1-2)

[ Source: q2-quality-filter  ]

plugin QIIME 2 per filtraggio e taglio basato su PHRED

QIIME 2 è un pacchetto per analisi del microbioma potente, estensibile e decentralizzato con attenzione a trasparenza di analisi e dati. QIIME2 permette ai ricercatori di iniziare un'analisi con dati di sequenze di DNA grezze e finire con figure di qualità di pubblicazione e risultati statistici. Caratteristiche principali:

 * tracciamento integrato e automatico della provenienza dei dati;
 * sistema di tipi semantici;
 * sistema a plugin per estendere le funzionalità di analisi del
   microbioma;
 * gestione per più tipi di interfacce utente (es. API, riga di comando,
   grafica).

QIIME 2 è un completo rifacimento e riscrittura della catena di analisi di microbioma QIIME 1. QIIME 2 risolve molte delle limitazioni di QIIME 1 mantenendo al contempo le funzionalità che fanno di QIIME 1 una catena di analisi potente e ampiamente utilizzata.

QIIME 2 attualmente gestisce una catena di elaborazione iniziale end-to-end per analisi del microbioma. Nuove funzionalità diventeranno regolarmente disponibili attraverso plugin per QIIME 2. Si può vedere un elenco dei plugin attualmente disponibili sulla pagina dei plugin disponibili di QIIME 2. La pagina dei plugin futuri elenca i plugin che sono in fase di sviluppo.

Other Packages Related to q2-quality-filter

• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

• dep: python3-pandas

  strutture dati per dati "relazionali" o "etichettati"

• dep: q2-types

  plugin QIIME 2 che definisce tipi per analisi di microbioma

• dep: q2templates

  pacchetto per modello di struttura per plugin QIIME 2

• dep: qiime

  Quantitative Insights Into Microbial Ecology

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