Package: gromacs-mpich (2020.6-2)

[ Source: gromacs  ]

simulatore di dinamica molecolare, binari per parallelizzazione MPICH

GROMACS è un pacchetto versatile per l'esecuzione di dinamiche molecolari, ovvero simulazioni delle equazioni newtoniane del moto per sistemi con un numero di particelle tra le centinaia e i milioni.

Progettato principalmente per biomolecole come proteine e lipidi con molte complesse interazioni di legame, GROMACS, essendo estremamente veloce nei calcoli per le interazioni di non-legame (che solitamente dominano le simulazioni) è anche utilizzato da molti gruppi per ricerche su sistemi non biologici, come ad esempio polimeri.

Questo pacchetto contiene solamente il motore principale di simulazione con gestione parallela usando l'interfaccia MPICH (v3). È adatto per i nodi di un cluster di elaborazione o per macchine multiprocessore.

Tags: Software Development: C Development, Libraries, Field: Biology, field::chemistry, implemented-in::c, User Interface: Command Line, Role: role::devel-lib, role::program, Scope: Utility, Works with: Packaged Software

Other Packages Related to gromacs-mpich

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libfftw3-double3 (>= 3.3.5)

  libreria per calcolare la trasformata di Fourier veloce (FFT) - precisione doppia

• dep: libfftw3-single3 (>= 3.3.5)

  libreria per calcolare la trasformata di Fourier veloce (FFT) - precisione singola

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: libhwloc15 (>= 2.4.1+dfsg)

  vista gerarchica della macchina - librerie condivise

• dep: libmpich12 (>= 3.4.1-3)

  Shared libraries for MPICH

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: mpich

  Implementation of the MPI Message Passing Interface standard

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  libreria di compressione - runtime

• rec: gromacs

  simulatore di dinamica molecolare, con strumenti di costruzione e di analisi

• sug: gromacs-data

  GROMACS simulatore di dinamica molecolare, dati e documentazione

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