Package: q2-types (2020.11.1-1)

[ Source: q2-types  ]

plugin QIIME 2 che definisce tipi per analisi di microbioma

QIIME 2 è un pacchetto per analisi del microbioma potente, estensibile e decentralizzato con attenzione a trasparenza di analisi e dati. QIIME2 permette ai ricercatori di iniziare un'analisi con dati di sequenze di DNA grezze e finire con figure di qualità di pubblicazione e risultati statistici. Caratteristiche principali:

 * tracciamento integrato e automatico della provenienza dei dati;
 * sistema di tipi semantici;
 * sistema a plugin per estendere le funzionalità di analisi del
   microbioma;
 * gestione per più tipi di interfacce utente (es. API, riga di comando,
   grafica).

QIIME 2 è un completo rifacimento e riscrittura della catena di analisi di microbioma QIIME 1. QIIME 2 risolve molte delle limitazioni di QIIME 1 mantenendo al contempo le funzionalità che fanno di QIIME 1 una catena di analisi potente e ampiamente utilizzata.

QIIME 2 attualmente gestisce una catena di elaborazione iniziale end-to-end per analisi del microbioma. Nuove funzionalità diventeranno regolarmente disponibili attraverso plugin per QIIME 2. Si può vedere un elenco dei plugin attualmente disponibili sulla pagina dei plugin disponibili di QIIME 2. La pagina dei plugin futuri elenca i plugin che sono in fase di sviluppo.

Other Packages Related to q2-types

• dep: libopenblas-base

  libreria BLAS (algebra lineare) ottimizzata (transizione)

• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

• dep: python3-biom-format

  formato BIOM (Biological Observation Matrix) (Python 3)

• dep: python3-h5py

  interfaccia Python di uso generico per hdf5

• dep: python3-ijson

  analizzatore JSON pilotato da eventi (versione per Python 3)

• dep: python3-numpy

  veloce struttura per array per il linguaggio Python 3

• dep: python3-pandas

  strutture dati per dati "relazionali" o "etichettati"

• dep: python3-setuptools

  miglioramenti per Python3 Distutils

• dep: python3-skbio

  strutture dati, algoritmi, risorse educative in Python 3 per bioinformatica

• dep: qiime (>= 2020.11.1)

  Quantitative Insights Into Microbial Ecology

Download q2-types

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	57.9 kB	592.0 kB	[list of files]