Package: igdiscover (0.11-3)

[ Source: igdiscover  ]

analizza repertori di anticorpi per trovare nuovi geni V

IgDiscover analizza repertori di anticorpi e scopre nuovi geni V da letture di sequenziamento ad alte prestazioni. Sono gestite catene pesanti e catene leggere kappa e lambda (per scoprire geni VH, VK e VL).

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• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

• dep: python3-cutadapt

  pulisce sequenze biologiche provenienti da letture di sequenziamento ad alte prestazioni (Python 3)

• dep: python3-matplotlib (>= 1.5.0)

  sistema di tracciamento grafici basato su Python in uno stile simile a Matlab (Python 3)

• dep: python3-numpy

  veloce struttura per array per il linguaggio Python 3

• dep: python3-pandas (>= 0.16.2)

  strutture dati per dati "relazionali" o "etichettati"

• dep: python3-ruamel.yaml

  analizzatore/emettitore YAML di roundtrip (modulo per Python 3)

• dep: python3-scipy (>= 0.16.1)

  strumenti scientifici per Python 3

• dep: python3-seaborn (>= 0.9)

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• dep: python3-sqt

  SeQuencing Tools for biological DNA/RNA high-throughput data

• dep: python3-xopen (>= 0.3.2)

  modulo Python 3 per aprire file compressi in modo trasparente

• sug: igdiscover-doc

  analizza repertori di anticorpi per trovare nuovi geni V - documentazione

• sug: snakemake

  sistema di gestione dei flussi di lavoro in Python

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