Package: mhap (2.1.3+dfsg-3)

[ Source: mhap  ]

hash con sensibilità locale per rilevare sovrapposizioni di letture lunghe

MinHash Alignment Process (MHAP, pronunciato MAP) è un'implementazione di riferimento di un algoritmo probabilistico per la sovrapposizione di sequenze. È progettato per rilevare in maniera efficiente tutte le sovrapposizioni tra letture lunghe in dati di sequenze con rumore. Stima in maniera efficiente la similarità di Jaccard comprimendo le sequenze nelle loro impronte digitali rappresentative composte su min-meri (minimi k-meri).

Other Packages Related to mhap

• dep: default-jre-headless

  Standard Java or Java compatible Runtime (headless)

• dep: jaligner

  algoritmo Smith-Waterman con miglioramento di Gotoh

• dep: jarwrapper

  esegue file .jar Java

• dep: libcommons-compress-java

  API Java per lavorare con i formati di compressione e archiviazione

• dep: libfastutil-java

  Java API providing type-specific maps, sets, lists and queues

• dep: libguava-java (>= 19)

  suite di librerie comuni di Google per Java

• dep: libssw-java

  Java bindings for libssw

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
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