Package: placnet (1.04-1)

[ Source: placnet  ]

progetto Plasmid Constellation Network

Placnet è un nuovo strumento per l'analisi di plasmidi in progetti NGS. Placnet è ottimizzato per lavorare con sequenze Illumina, ma funziona anche con 454, Iontorrent o qualsiasi tecnologia di sequenziamento esistente.

L'input di Placnet è un insieme di contigui e uno o più file SAM con la mappatura tra le letture e i contigui. Placnet ottiene un insieme di file facilmente aperti nel software Cytoscape o in altri strumenti di rete.

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