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Package: king-probe (02.21-1)

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valuta e visualizza il fattore di impacchettamento interatomico delle proteine

king-probe è un programma che permette di valutare il fattore di impacchettamento interatomico, all'interno delle molecole e fra molecole. Genera "punti di contatto" dove gli atomi sono a stretto contatto.

Il programma king-probe genera "punti di contatto" nei punti sulla superficie di van der Waals degli atomi che sono in stretta prossimità di altri atomi; leggendo le coordinate atomiche da file in formato PDB (protein databank) e scrivendo liste di punti con colori codificati (punte dove gli atomi si scontrano) per l'inclusione in una immagine animata.

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