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Package: indigo-utils (1.2.3-3.1)

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utilità per toolkit per chimica organica

Indigo è un ambiente software basato sul C++ per chimica organica e chemioinformatica. Le funzionalità includono:

 * rendering di molecole e reazioni incluso il supporto per SVG;
 * disposizione automatica di molecole e reazioni rappresentate in SMILES;
 * calcolo canonico (isomerico) di SMILES;
 * corrispondenza esatta, corrispondenza di sottostrutture, corrispondenza
   SMARTS;
 * corrispondenza di tautomeri e strutture di risonanza;
 * calcolo di similarità delle molecole, impronte digitali delle molecole;
 * veloce enumerazione di anelli SSSR, sottoalberi e sottografi di margini;
 * calcolo di formula molecolare, peso molecolare;
 * rilevamento di scaffold e deconvoluzione R-Group;
 * calcolo della sottostruttura comune massima esatta per un numero
   arbitrario di strutture di input;
 * chimica combinatoria;
 * supporto per plugin nell'API.

I formati di file supportati da Indigo includono MDL Mol, SDF, RDF, CML, SMILES e SMARTS.

Questo pacchetto contiene le seguenti utilità:

 * indigo-depict: utilità per rendering di molecole e reazioni;
 * indigo-cano: generatore di SMILES canonici;
 * indigo-deco: utilità per deconvoluzione R-Group;
 * chemdiff: confronto visivo di due file SDF o SMILES (ha bisogno delle
   librerie JAVA).

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