Package: fastqtl (2.184+v7+dfsg-3)

[ Source: fastqtl  ]

mappatore Quantitative Trait Loci (QTL) in cis per fenotipi molecolari

L'obiettivo di FastQTL è di identificare polimorfismi a nucleotide singolo (SNP) che sono associati in maniera significativa a vari fenotipi molecolari (cioè espressioni di geni conosciuti, livelli di metilazione della citosina, ecc.). Esegue scansioni per tutte le possibili coppie fenotipo-variante in cis (cioè varianti localizzate all'interno di una finestra specifica intorno a un fenotipo). FastQTL implementa un nuovo schema di permutazione (approssimazione Beta) per correggere accuratamente e velocemente test multipli sia a livello di genotipo sia di fenotipo.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, User Interface: interface::commandline, role::program, Purpose: Analysing

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