Package: r-bioc-genomicranges (1.50.2+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-genomicranges  ]

rappresentazione e manipolazione di intervalli genomici di BioConductor

La capacità di archiviare in modo efficiente le annotazioni e gli allineamenti genomici ha un ruolo centrale nell'analisi di dati di sequenziamento ad alte prestazioni (alias dati NGS). Il pacchetto definisce contenitori generici per archiviare intervalli genomici oltre a contenitori più specializzati per archiviare allineamenti rispetto ad un genoma di riferimento.

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  Libreria C GNU: librerie condivise
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  rappresentazione e manipolazione di sequenze esterne per BioConductor

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• sug: r-bioc-annotationhub

  client GNU R per accedere a risorse AnnotationHug

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  GNU R inference of differential exon usage in RNA-Seq

• sug: r-bioc-edger

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• sug: r-bioc-genomicalignments

  rappresentazione e manipolazione di allineamenti genomici corti per BioConductor

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  strumenti per GNU R per fare annotazioni centrate su trascritti e manipolarle

• sug: r-bioc-gviz

  disegno di dati e informazioni di annotazioni vicino a coordinate genomiche

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• sug: r-bioc-rsamtools (>= 1.13.53)

  allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R

• sug: r-bioc-rtracklayer

  interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione

• sug: r-bioc-summarizedexperiment (>= 0.1.5)

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• sug: r-bioc-variantannotation

  annotazione di varianti genetiche per BioConductor

• sug: r-cran-digest

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• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-matrix

  pacchetto GNU R di classi per matrici dense e sparse

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1,753.8 kB	2,743.0 kB	[list of files]
arm64	1,753.2 kB	2,759.0 kB	[list of files]
armel	1,751.3 kB	2,758.0 kB	[list of files]
armhf	1,751.5 kB	2,758.0 kB	[list of files]
i386	1,754.3 kB	2,750.0 kB	[list of files]
mips64el	1,751.2 kB	2,764.0 kB	[list of files]
mipsel	1,751.3 kB	2,763.0 kB	[list of files]
ppc64el	1,753.6 kB	2,759.0 kB	[list of files]
s390x	1,752.9 kB	2,743.0 kB	[list of files]