Package: r-bioc-biomart (2.54.0+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-biomart  ]

interfaccia GNU R ai database BioMart (Ensembl, COSMIC, Wormbase e Gramene)

Negli anni recenti una messe di dati biologici è diventata disponibile in repository pubblici di dati. Un facile accesso a tali preziose risorse di dati e una solida integrazione con l'analisi dei dati sono una necessità per una esauriente analisi di dati bioinformatici. biomaRt fornisce un'interfaccia per una crescente raccolta di database che implementa la suite di software BioMart (http://www.biomart.org). Questo pacchetto permette di recuperare grandi quantità di dati in maniera uniforme senza la necessità di conoscere gli schemi del database sottostante o di scrivere complesse interrogazioni SQL. Esempi dei database BioMart sono Ensembl, COSMIC, Uniprot, HGNC, Gramene, Wormbase e dbSNP mappato su Ensembl. Tali importanti database danno agli utenti di biomaRt accesso diretto a un insieme variegato di dati e permettono un'ampia gamma di potenti interrogazioni online dall'annotazione dei geni al database mining.

Other Packages Related to r-bioc-biomart

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

  nocciolo del sistema per calcoli e grafici statistici GNU R

• dep: r-bioc-annotationdbi

  GNU R Annotation Database Interface per BioConductor

• dep: r-bioc-biocfilecache

  GNU R management of files across sessions

• dep: r-cran-digest

  pacchetto GNU R per "hash digest" di strutture dati di R

• dep: r-cran-httr

  strumenti GNU R per lavorare con URL e HTTP

• dep: r-cran-progress

  barre di avanzamento per il terminale di GNU R

• dep: r-cran-rappdirs

  directory delle applicazioni per GNU R

• dep: r-cran-stringr

  rende più semplice lavorare con stringhe

• dep: r-cran-xml (>= 3.99-0.7)

  pacchetto GNU R per l'analisi e la generazione di XML

• dep: r-cran-xml2

  analizzatore XML per GNU R

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-mockery

  libreria di mock per GNU R

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  suite di test di GNU R

• sug: r-cran-webmockr

  GNU R stubbing and setting expectations on 'HTTP' requests

Download r-bioc-biomart

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	431.8 kB	628.0 kB	[list of files]