Package: debichem-analytical-biochemistry (0.0.12)

[ Source: debichem  ]

biochimica analitica per DebiChem

Questo metapacchetto installa pacchetti che permettono di:

 - caricare e convertire file di dati di spettrometria di massa;
 - modificare sequenze di biopolimeri;
 - elaborare flussi di lavoro complessi di spettrometria di massa;
 - effettuare ricerche in database di proteine usando dati da tandem-ms;
 - visualizzare ed esplorare dati di spettrometria di massa;
 - simulare cluster isotopici;
 - implementare flussi di lavoro di proteomica.

Other Packages Related to debichem-analytical-biochemistry

• dep: debichem-tasks (= 0.0.12)

  task DebiChem per tasksel

• rec: libmstoolkit-tools

  librerie per manipolare dati di spettrometria di massa - strumenti

• rec: libpwiz-tools

  strumenti a riga di comando di ProteoWizard

• rec: lutefisk

  interpretazione de novo dello spettro CID del peptide

• rec: massxpert

  simulazione di dati di spettrometria di massa e modellazione per chimica dei polimeri (runtime)

• rec: minexpert2

  estrazione e visualizzazione di dati spettrometrici di massa MS^n (runtime)

• rec: openms

  pacchetto per gestione ed analisi di dati LC/MS

• rec: python3-pymzml

  analisi di dati di spettrometria di massa mzML (Python 3.x)

• rec: r-cran-maldiquant

  pacchetto GNU R per analisi quantitativa di dati di spettrometria di massa

• rec: r-cran-maldiquantforeign

  pacchetto GNU R che fornisce funzioni di importazione ed esportazione per MALDIquant

• rec: r-cran-mixtools

  strumenti GNU R per analizzare modelli finiti misti

• rec: r-cran-readbrukerflexdata

  pacchetto GNU R per leggere file in formato *flex di Bruker Daltonics

• rec: r-cran-readmzxmldata

  pacchetto GNU R per leggere dati di spettrometria di massa in formato mzXML

• rec: r-other-amsmercury

  calcolo efficiente di massa e abbondanza accurate per picchi isotopici

• rec: r-other-curvefdp

  stima dei livelli di confidenza per l'identificazione di peptidi

• rec: r-other-iwrlars

  regressione least angle, lasso, lasso positivo e forward stagewise

• rec: r-other-nitpick

  identificazione dei picchi per dati di spettrometria di massa

• rec: tandem-mass

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• rec: toppic

  identificazione e caratterizzazione top-down di proteoforme (programmi)

• rec: xtpcpp

  Package not available

• sug: biceps

  Package not available

• sug: libisospec++-dev

  Isotopic fine structure calculator (C++ development files)

• sug: libpwiz-dev

  libreria per effettuare analisi di dati di proteomica (file di sviluppo)

• sug: libpwizlite-dev

  libreria per caricare file mzML/mzXML (file di sviluppo)

• sug: mmass

  Package not available

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