Package: meryl (0~20150903+r2013-8 and others)

[ Source: kmer  ]

conteggio di k-meri in- e out-of-core e utilità

meryl calcola il contenuto di k-meri di sequenze genomiche. Il contenuto di k-meri è rappresentato come una lista di k-meri e il numero di volte che ognuno di essi appare nelle sequenze di input. Il k-mero può essere ristretto solamente al k-mero forward, solo a quello reverse o al k-mero canonico (lessicograficamente più piccolo del k-mero forward e reverse ad ogni posizione). Meryl può riportare l'istogramma dei conteggi, la lista dei k-meri e il loro conteggio o può effettuare operazioni matematiche o insiemistiche sui file dei dati elaborati.

Questo pacchetto fa parte della suite Kmer.

Other Packages Related to meryl

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• sug: gridengine-client

  utilità per la gestione di code di Grid Engine

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
mips64el	0~20150903+r2013-8+b3	210.1 kB	1,821.0 kB	[list of files]