Package: kalign (1:3.3.5-1)

[ Source: kalign  ]

allineamenti multipli di sequenza globali e progressivi

Kalign è uno strumento a riga di comando per fare allineamenti multipli di sequenze biologiche. Usa l'algoritmo per corrispondenze di stringhe Muth-Manber per migliorare sia l'accuratezza che la velocità dell'allineamento. Usa un approccio globale, progressivo per l'allineamento, arricchito dall'uso di un algoritmo per corrispondenze approssimate di stringhe per calcolare le distanze tra le sequenze e incorporando corrispondenze locali nell'allineamento globale.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to kalign

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• enh: bioperl-run

  wrapper BioPerl: script

• enh: t-coffee

  allineamento di sequenze multiple

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
mips64el	79.1 kB	418.0 kB	[list of files]