Package: clustalx (2.1+lgpl-9)

[ Source: clustalx  ]

allineamento multiplo di sequenze di acidi nucleici e di proteine (interfaccia grafica)

Questo pacchetto offre un'interfaccia grafica per il programma di allineamento di sequenze multiple Clustal. Fornisce un ambiente integrato per effettuare allineamenti di sequenze e profili multipli per analizzare i risultati. L'allineamento delle sequenze è visualizzato in una finestra sullo schermo. Uno schema di colorazione versatile è stato incorporato per evidenziare le caratteristiche conservate nell'allineamento. Per le presentazioni professionali occorre usare il pacchetto LaTeX texshade o boxshade.

Il menù a tendina in alto nella finestra permette di selezionare tutte le opzioni richieste per l'allineamento tradizionale di sequenze e profili multipli. Possono essere copiate ed incollate le sequenze per modificare l'ordine dell'allineamento; si può selezionare un sottoinsieme di sequenze che devono essere allineate; si può selezionare un sottointervallo dell'allineamento per essere riallineato e reinserito in quello originale.

Può essere fatta un'analisi qualitativa dell'allineamento e possono essere evidenziati i segmenti con basso punteggio o i residui eccezionali.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, User Interface: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: Lesstif/Motif, uitoolkit::qt, use::analysing, Purpose: Comparing, use::viewing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag, X Window System: Application

Other Packages Related to clustalx

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libqt5core5a (>= 5.7.0)

  modulo principale di Qt 5

• dep: libqt5gui5 (>= 5.2.0)

  modulo GUI di Qt 5

  or libqt5gui5-gles (>= 5.2.0)

  modulo GUI di Qt 5 — variante OpenGL ES

• dep: libqt5widgets5 (>= 5.0.2)

  modulo per widgets di Qt 5

• dep: libqt5xml5 (>= 5.0.2)

  modulo XML di Qt 5

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• sug: boxshade

  belle stampe di allineamenti multisequenza

• sug: clustalw

  allineamento globale per sequenze multiple di nucleotidi o peptidi

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX additional packages

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
mips64el	385.7 kB	1,617.0 kB	[list of files]