Package: topp (2.6.0+cleaned1-3 and others)

[ Source: openms  ]

insieme di programmi che implementano TOPP (The OpenMS Proteomic Pipeline)

TOPP (The OpenMS Proteomic Pipeline) è un flusso elaborativo per l'analisi di dati HPLC/MS. Consiste di un insieme di numerose piccole applicazioni che possono essere concatenate assieme per creare un flusso elaborativo di analisi confezionato per un problema specifico. Le applicazioni utilizzano la libreria libopenms. Alcuni esempi di tali applicazioni sono:

 - TOPPView: un visualizzatore per dati di spettrometria di massa;
 - TOPPAS: un assistente per la progettazione di flussi di lavoro TOPP
   guidati da una GUI;
 - DTAExtractor: estrae gli spettri di un file di un'analisi MS in diversi
   file in formato DTA;
 - FileConverter: converte tra diversi formati di file MS;
 - FileFilter: estrae o manipola porzioni di dati da file di picco, di
   funzionalità o di funzionalità di consenso;
 - SpectraMerger: unisce gli spettri da una mappa LC/MS, sia da precursori
   sia da blocchi RT;
 - BaselineFilter: rimuove la base di rilevamento da un profilo di uno
   spettro utilizzando un filtro top-hat;
 - InternalCalibration: applica una calibrazione interna;
 - PTModel: addestra un modello per la predizione di peptidi proteici da
   un insieme di addestramento;
 - RTPredict: predice il tempo di ritenzione dei peptidi utilizzando un
   modello addestrato da RTModel;
 - ExecutePipeline: esegue flussi di lavoro creati da TOPPAS.

Tags: Interface Toolkit: Qt

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