[ Source: openms ]
Package: topp (2.6.0+cleaned1-3 and others)
Links for topp
Debian Resources:
Download Source Package openms:
- [openms_2.6.0+cleaned1-3.dsc]
- [openms_2.6.0+cleaned1.orig.tar.gz]
- [openms_2.6.0+cleaned1-3.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [www.openms.de]
Similar packages:
insieme di programmi che implementano TOPP (The OpenMS Proteomic Pipeline)
TOPP (The OpenMS Proteomic Pipeline) è un flusso elaborativo per l'analisi di dati HPLC/MS. Consiste di un insieme di numerose piccole applicazioni che possono essere concatenate assieme per creare un flusso elaborativo di analisi confezionato per un problema specifico. Le applicazioni utilizzano la libreria libopenms. Alcuni esempi di tali applicazioni sono:
- TOPPView: un visualizzatore per dati di spettrometria di massa; - TOPPAS: un assistente per la progettazione di flussi di lavoro TOPP guidati da una GUI; - DTAExtractor: estrae gli spettri di un file di un'analisi MS in diversi file in formato DTA; - FileConverter: converte tra diversi formati di file MS; - FileFilter: estrae o manipola porzioni di dati da file di picco, di funzionalità o di funzionalità di consenso; - SpectraMerger: unisce gli spettri da una mappa LC/MS, sia da precursori sia da blocchi RT; - BaselineFilter: rimuove la base di rilevamento da un profilo di uno spettro utilizzando un filtro top-hat; - InternalCalibration: applica una calibrazione interna; - PTModel: addestra un modello per la predizione di peptidi proteici da un insieme di addestramento; - RTPredict: predice il tempo di ritenzione dei peptidi utilizzando un modello addestrato da RTModel; - ExecutePipeline: esegue flussi di lavoro creati da TOPPAS.
Other Packages Related to topp
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- dep: libboost-regex1.74.0-icu72
- virtual package provided by libboost-regex1.74.0
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- libreria di supporto a GCC
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)
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- dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-3+b4)
- libreria per gestione ed analisi di dati LC/MS - runtime
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- dep: libqt5core5a (>= 5.15.1)
- modulo principale di Qt 5
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- dep: libqt5gui5 (>= 5.11.3)
- modulo GUI di Qt 5
- or libqt5gui5-gles (>= 5.11.3)
- modulo GUI di Qt 5 — variante OpenGL ES
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- dep: libqt5widgets5 (>= 5.11.3)
- modulo per widgets di Qt 5
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- dep: libstdc++6 (>= 11)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
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- dep: libxerces-c3.2
- libreria per analizzatore XML con validazione per C++
-
- dep: openms-common (= 2.6.0+cleaned1-3)
- pacchetto per gestione ed analisi di dati LC/MS - dati condivisi
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- sug: openms-doc
- pacchetto per gestione ed analisi di dati LC/MS - documentazione
Download topp
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
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i386 | 2.6.0+cleaned1-3+b4 | 3,310.2 kB | 17,410.0 kB | [list of files] |