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post-elaborazione e classificazione di retrotrasposoni LTR

LTRsift è uno strumento grafico per desktop che fa post-elaborazione semi-automatica delle annotazioni di retrotrasposoni LTR predetti de novo, come quelle generate da LTRharvest e LTRdigest. La sua interfaccia facile da usare mostra i candidati per i retrotrasposoni LTR, le loro famiglie putative e la loro struttura in modo gerarchico, permettendo all'utente di "vagliare" ("sift") i risultati, a volte numerosi, del software di predizione de novo. Offre anche funzionalità di filtraggio e di classificazione personalizzabili.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, User Interface: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: GTK, Purpose: use::analysing, use::browsing, Comparing, Data Organisation, use::viewing, x11::application

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