[ Source: velvet ]
Package: velvet-long (1.2.10+dfsg1-8)
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- Homepage [github.com]
Similar packages:
assemblatore di sequenze di acidi nucleici da sequenze molto corte, versione lunga
Velvet è un assemblatore genomico de novo progettato specificatamente per le tecnologie di sequenziamento basate su sequenze corte, come Solexa o 454, sviluppato da Daniel Zerbino e Ewan Birney all'European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), vicino a Cambridge, in Gran Bretagna.
Velvet attualmente accetta sequenze molto corte, rimuove errori e poi produce frammenti contigui unici di alta qualità. Poi usa informazioni sulle paired-read, se disponibili, per recuperare le aree ripetute tra i vari frammenti contigui.
Questo pacchetto installa versioni speciali in modalità lunga di Velvet, come raccomandato nei tutorial di Velvet.
Other Packages Related to velvet-long
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)
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- dep: velvet
- assemblatore di sequenze di acidi nucleici da sequenze molto corte
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)
- libreria di compressione - runtime
Download velvet-long
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| armel | 216.1 kB | 2,309.0 kB | [list of files] |