Package: python3-mappy (2.24+dfsg-3 and others)

[ Source: minimap2  ]

interfaccia Python 3 per minimap2

Minimap2 è un versatile programma per l'allineamento di sequenze che allinea sequenze di DNA o mRNA rispetto a un grande database di riferimento. Casi d'uso tipici includono: (1) mappatura di letture genomiche PacBio o Oxford Nanopore con il genoma umano; (2) ricerca di sovrapposizioni tra letture lunghe con tassi di errore fino a ~15%; (3) allineamento, tenendo conto degli splice, di letture PacBio Iso-Seq o Nanopore cDNA o Direct RNA rispetto a un genoma di riferimento; (4) allineamento di letture Illumina singole o accoppiate; (5) allineamento assemblaggio-verso-assemblaggio; (6) allineamento dell'intero genoma tra due specie strettamente imparentate con divergenza sotto a ~15%.

Questo pacchetto contiene l'interfaccia Python 3 per usare minimap2.

Other Packages Related to python3-mappy

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  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: python3

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  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  libreria di compressione - runtime

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
armel	2.24+dfsg-3+b1	143.1 kB	380.0 kB	[list of files]