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Package: pbsim (1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3)

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simulatore per letture di sequenziamento PacBio

I sequenziatori di DNA PacBio producono due tipi di letture caratteristiche: CCS (corte e con basso tasso d'errore) e CLR (lunghe e con alto tasso d'errore), che possono essere entrambe utili per l'assemblaggio de novo di genomi. PBSIM simula tali letture PacBio da una sequenza di riferimento usando una simulazione basata su modello o su campionamento. Le letture simulate sono utili, ad esempio, quando si sviluppano o valutano assemblatori di sequenza pensati per dati PacBio.

Tags: Biology: Nucleic Acids, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Role: Program, Purpose: use::simulating, works-with::biological-sequence

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