Package: ataqv (1.3.0+ds-2)

[ Source: ataqv  ]

QC e visualizzazione di ATAC-seq

Toolkit per misurare e confrontare i risultati di ATAC-seq realizzato dal laboratorio Parker alla University of Michigan. È stato scritto per aiutare a capire quanto bene ha funzionato il saggio ATAC-seq e facilitare l'individuazione di differenze che potrebbero essere causate dalla preparazione della libreria o dal sequenziamento.

Tags: Interface Toolkit: Ncurses TUI

Other Packages Related to ataqv

• dep: fonts-font-awesome

  tipo di carattere per icone pensato per l'uso con Twitter Bootstrap

• dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0)

  rappresentazione C++ di intervalli temporali, punti temporali e orologi

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  operazioni su filesystem (percorsi portabili, iterazione su directory, ecc.) in C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  libreria Boost.Iostreams

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.5)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  libreria C per formati di dati di sequenziamento ad alte prestazioni

• dep: libjs-jquery

  libreria JavaScript per applicazioni web dinamiche

• dep: libjs-jquery-datatables

  jQuery plug-in that makes nice tables from different data sources

• dep: libjs-jquery-datatables-extensions

  extensions for the jQuery plug-in for tables from different data sources

• dep: libncurses6 (>= 6)

  librerie condivise per la gestione del terminale

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: node-d3

  Data-Driven Documents to visualize data

• dep: node-normalize.css

  Modern alternative to CSS resets

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: macs

  analisi basata su modelli di ChIP-Seq su sequenziatori di letture corte

• sug: picard-tools

  strumenti a riga di comando per manipolare file SAM e BAM

• sug: samtools

  elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM

• sug: wget

  scarica file dal web

Download ataqv

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
arm64	3,266.8 kB	6,464.0 kB	[list of files]