Package: jmodeltest (2.1.10+dfsg-12)

[ Source: jmodeltest  ]

selezione HPC di modelli di sostituzione di nucleotide

jModelTest è uno strumento per eseguire la selezione statistica di modelli best-fit di sostituzione di nucleotide. Implementa cinque differenti strategie di selezione dei modelli: test di tasso di probabilità dinamica e gerarchica (dLRT e hLRT), criteri di informazione bayesiana e Akaike (BIC e AIC) e un metodo della teoria della decisione (DT). Fornisce anche stima dell'incertezza della selezione del modello, importanze dei parametri e stime dei parametri mediate sul modello, incluse topologie dell'albero mediate sul modello. jModelTest 2 include funzionalità per High Performance Computing (HPC) e funzionalità aggiuntive come nuove strategie per l'ottimizzazione dell'albero, alberi filogenetici mediati sul modello (sia topologia sia lunghezza del ramo), filtraggio euristico e registrazione automatica dell'attività dell'utente.

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