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Package: autodock-getdata (4.2.6-9)

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istruzioni per getData per raccogliere composti

Questo pacchetto fornisce le istruzioni per getData per recuperare le descrizioni di insiemi di composti molecolari che possono essere usate direttamente come input per autodock. I dati non sono forniti direttamente da questo pacchetto; qui sono mantenute solo le istruzioni per scaricarle.

Il progetto FightAids@home della World Community Grid fornisce pubblicamente i set di input delle loro corse. Le strutture originali vengono dal database ZINC e sono state elaborate dal formato mol2 a quello pdbqt dall'istituto Scripps:

 * asinex,
 * chembridge_buildingblocks_pdbqt_1000split,
 * drugbank_nutraceutics,
 * drugbank_smallmol,
 * fda_approved,
 * human_metabolome_pdbqt_1000split,
 * otava,
 * zinc_natural_products.

Quando si usano tali dati, citare il database ZINC.

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