Paquet : r-bioc-genomicfiles (1.40.0+dfsg-1)

[ Paquet source : r-bioc-genomicfiles  ]

Distributed computing by file or by range

This package provides infrastructure for parallel computations distributed 'by file' or 'by range'. User defined MAPPER and REDUCER functions provide added flexibility for data combination and manipulation.

Autres paquets associés à r-bioc-genomicfiles

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel (>= 1.38.0)

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.40.1)

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

• dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.40.0)

  BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1)

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)

  conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers

• dep: r-bioc-matrixgenerics (>= 1.16.0)

  S4 Generic Summary Statistic Functions that Operate on Matrix-Like Objects

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 2.20.0)

  importation de fichiers BAM, BCF et tabix pour GNU R

• dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.64.0)

  GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0)

  BioConductor assay container

• dep: r-bioc-variantannotation (>= 1.50.0)

  BioConductor annotation of genetic variants

• sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1)

  GNU R string objects representing biological sequences

• sug: r-bioc-genefilter (>= 1.86.0)

  méthodes de filtrage de gènes à partir d’expériences sur puce

• sug: r-bioc-snpstats (>= 1.54.0)

  méthodes et les classes de SnpMatrix et XSnpMatrix de BioConductor

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-runit

  paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	528,9 ko	784,0 ko	[liste des fichiers]