Paquet : python3-pdb2pqr (3.6.1+dfsg-1)

[ Paquet source : pdb2pqr  ]

Preparation of protein structures for electrostatics calculations

PDB2PQR is a Python software package that automates many of the common tasks of preparing structures for continuum electrostatics calculations. It thus provides a platform-independent utility for converting protein files in PDB format to PQR format. These tasks include:

 * Adding a limited number of missing heavy atoms to biomolecular structures
 * Determining side-chain pKas
 * Placing missing hydrogens
 * Optimizing the protein for favorable hydrogen bonding
 * Assigning charge and radius parameters from a variety of force fields

Autres paquets associés à python3-pdb2pqr

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-docutils

  système de traitement de texte pour reStructuredText – implémentation en Python 3

• dep: python3-numpy

  gestion rapide des tableaux pour le langage Python – Python 3

• dep: python3-pdbx

  utilities for PDBx/mmCIF storage model (Python 3)

• dep: python3-propka

  heuristic pKa calculations with ligands (Python 3)

• dep: python3-requests

  bibliothèque HTTP simple et élégante pour Python3, construite pour les êtres humains

Télécharger python3-pdb2pqr

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	132,6 ko	1 142,0 ko	[liste des fichiers]