Paquet : r-bioc-hdf5array (1.32.1-1 et autres)

[ Paquet source : r-bioc-hdf5array  ]

HDF5 backend for DelayedArray objects

Implements the HDF5Array and TENxMatrix classes, 2 convenient and memory-efficient array-like containers for on-disk representation of HDF5 datasets. HDF5Array is for datasets that use the conventional (i.e. dense) HDF5 representation. TENxMatrix is for datasets that use the HDF5-based sparse matrix representation from 10x Genomics (e.g. the 1.3 Million Brain Cell Dataset). Both containers being DelayedArray extensions, they support all operations supported by DelayedArray objects. These operations can be either delayed or block-processed.

Autres paquets associés à r-bioc-hdf5array

• dep: libc6 (>= 2.14)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libhdf5-310 (>= 1.14.4.3)

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libhdf5-hl-310

  HDF5 High Level runtime files - serial version

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-delayedarray (>= 0.30.1)

  BioConductor delayed operations on array-like objects

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)

  conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers

• dep: r-bioc-rhdf5 (>= 2.48.0)

  BioConductor HDF5 interface to R

• dep: r-bioc-rhdf5filters (>= 1.16.0)

  GNU R HDF5 compression filters

• dep: r-bioc-rhdf5lib (>= 1.26.0)

  GNU R hdf5 library

• dep: r-bioc-s4arrays (>= 1.4.1)

  foundation of array-like containers in Bioconductor

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-cran-matrix

  paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses

• sug: r-bioc-biocparallel (>= 1.38.0)

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• sug: r-bioc-delayedmatrixstats (>= 1.26.0)

  fonctions pour les lignes et les colonnes des objets « DelayedMatrix »

• sug: r-bioc-experimenthub (>= 2.12.0)

  client BioConductor pour accéder aux ressources d’ExperimentHub

• sug: r-bioc-genefilter (>= 1.86.0)

  méthodes de filtrage de gènes à partir d’expériences sur puce

• sug: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.56.0)

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

• sug: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1)

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• sug: r-bioc-singlecellexperiment (>= 1.26.0)

  S4 Classes for Single Cell Data

• sug: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0)

  BioConductor assay container

• sug: r-cran-runit

  paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires

Télécharger r-bioc-hdf5array

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1.32.1-1+b1	8 567,6 ko	9 062,0 ko	[liste des fichiers]