Paquet : bamclipper (1.0.0-3)

[ Paquet source : bamclipper  ]

Remove gene-specific primer sequences from SAM/BAM alignments

Remove gene-specific primer sequences from SAM/BAM alignments of PCR amplicons by soft-clipping.

bamclipper.sh soft-clips gene-specific primers from BAM alignment file based on genomic coordinates of primer pairs in BEDPE format.

Autres paquets associés à bamclipper

• dep: parallel

  build and execute command lines from standard input in parallel

• dep: perl

  langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

• dep: samtools

  traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	6,3 ko	30,0 ko	[liste des fichiers]