Paketti: bamclipper (1.0.0-3)

[ Source: bamclipper  ]

Remove gene-specific primer sequences from SAM/BAM alignments

Remove gene-specific primer sequences from SAM/BAM alignments of PCR amplicons by soft-clipping.

bamclipper.sh soft-clips gene-specific primers from BAM alignment file based on genomic coordinates of primer pairs in BEDPE format.

Muut pakettiin bamclipper liittyvät paketit

• dep: parallel

  build and execute command lines from standard input in parallel

• dep: perl

  Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten

• dep: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Imuroi bamclipper

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
all	6.3 kt	30.0 kt	[tiedostoluettelo]