Paquet : vcftools (0.1.16-3 et autres)

[ Paquet source : vcftools  ]

ensemble d'outils pour travailler avec les fichiers VCF

VCFtools est un paquet conçu pour travailler avec les fichiers au format VCF, tels que ceux générés par le projet « 1000 Genomes ». L'objectif de VCFtools est de fournir des méthodes pour travailler avec les fichiers au format VCF : valider, fusionner, comparer et calculer certaines statistiques génétiques de la population représentative.

Étiquettes: Rôle: Programme

Autres paquets associés à vcftools

• dep: libc6 (>= 2.29) [hppa, m68k, ppc64, sparc64, x32]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.32) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [amd64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, s390x]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: perl

  langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

  Bibliothèque de compression - binaires

• rec: tabix

  indexeur générique pour fichiers de positions de génome, délimités par des tabulations

Télécharger vcftools

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	0.1.16-3	417,7 ko	1 859,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	0.1.16-3+b1	420,5 ko	1 663,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	0.1.16-3+b2	397,7 ko	1 682,0 ko	[liste des fichiers]
armel	0.1.16-3+b1	371,9 ko	1 554,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	0.1.16-3+b1	382,2 ko	1 362,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	0.1.16-3	397,4 ko	1 576,0 ko	[liste des fichiers]
i386	0.1.16-3+b1	449,0 ko	1 782,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	0.1.16-3	500,1 ko	2 677,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	0.1.16-3	402,4 ko	1 641,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	0.1.16-3+b1	377,5 ko	1 778,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	0.1.16-3	409,4 ko	1 874,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	0.1.16-3+b1	412,3 ko	1 811,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	0.1.16-3+b1	410,5 ko	1 406,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	0.1.16-3+b1	382,8 ko	1 667,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	0.1.16-3	489,5 ko	1 578,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	0.1.16-3	355,7 ko	1 567,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	0.1.16-3	419,0 ko	1 621,0 ko	[liste des fichiers]