Paquet : uncalled (2.3+ds-2 et autres)

[ Paquet source : uncalled  ]

Utility for Nanopore Current Alignment to Large Expanses of DNA

Streaming algorithm for mapping raw nanopore signal to DNA references

Enables real-time enrichment or depletion on Oxford Nanopore Technologies (ONT) MinION runs via ReadUntil.

Also supports standalone signal mapping of fast5 reads

Autres paquets associés à uncalled

• dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, ia64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, mips64el, ppc64, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libhdf5-103-1t64

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, m68k]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [non ia64, m68k]

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.12~) [non ia64]

• dep: python3-numpy

  gestion rapide des tableaux pour le langage Python – Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [non armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  Bibliothèque de compression - binaires

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Télécharger uncalled

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	2.3+ds-2	564,8 ko	2 180,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	2.3+ds-2	611,5 ko	1 994,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.3+ds-2	539,6 ko	1 910,0 ko	[liste des fichiers]
armel	2.3+ds-2	518,5 ko	1 697,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2.3+ds-2	535,2 ko	1 341,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	2.3+ds-2	607,9 ko	2 143,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2.3+ds-2	654,8 ko	2 037,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	2.3+ds-1+b1	861,6 ko	6 434,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	2.3+ds-2	563,6 ko	1 861,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2.3+ds-2	522,0 ko	2 291,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	2.3+ds-2	584,3 ko	2 294,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.3+ds-2	595,3 ko	2 230,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.3+ds-2	597,1 ko	1 610,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2.3+ds-2	603,1 ko	2 042,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	2.3+ds-2	721,1 ko	1 913,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	2.3+ds-2	493,7 ko	2 369,0 ko	[liste des fichiers]