Paquet : scrappie (1.4.2-8 et autres) [debports]

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basecaller for Nanopore sequencer

The Nanopore is a device for DNA/RNA sequencing that does not require an amplification of the material. The polynucleotides are threaded through a pore and while these pass through, the change in the electrostatic potential allows one to identify ("call") the actual base that resides in the pore. Scrappie goes a step further and also attempts to describe modifications to the nucleic acid.

Autres paquets associés à scrappie

• dep: libblas3

  implémentation de référence en algèbre linéaire de base - bibliothèque partagée

  ou libblas.so.3

  paquet virtuel fourni par libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 6)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libhdf5-103-1t64

  HDF5 C runtime files - serial version

Télécharger scrappie

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
ppc64 (portage non officiel)	1.4.2-8+b6	17 991,1 ko	22 364,0 ko	[liste des fichiers]