Paket: scrappie (1.4.2-8 und andere) [debports]

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basecaller for Nanopore sequencer

The Nanopore is a device for DNA/RNA sequencing that does not require an amplification of the material. The polynucleotides are threaded through a pore and while these pass through, the change in the electrostatic potential allows one to identify ("call") the actual base that resides in the pore. Scrappie goes a step further and also attempts to describe modifications to the nucleic acid.

Andere Pakete mit Bezug zu scrappie

• dep: libblas3

  Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

  oder libblas.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libhdf5-103-1t64

  Hierarchisches Datenformat 5 (HDF5) - C-Laufzeitdateien - serielle Version

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.4.2-8+b6	17.991,1 kB	22.364,0 kB	[Liste der Dateien]