Paquet : soapdenovo2 (242+dfsg-3) [debports]

[ Paquet source :  ]

méthode d'assemblage de lectures courtes pour construire un assemblage brouillon de novo

Le logiciel SOAPdenovo est une nouvelle méthode d'assemblage à lectures courtes qui peut construire un assemblage brouillon de novo pour les génomes de taille humaine. Le logiciel est spécialement conçu pour assembler les lectures courtes de la machine Genome Analyzer IIx de l'entreprise Illumina.

Il crée de nouvelles opportunités pour la construction de séquences de référence et la réalisation des analyses précises des génomes inexplorés de manière économique.

Autres paquets associés à soapdenovo2

• dep: libc6.1 (>= 2.36)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libunwind8

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger soapdenovo2

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
ia64 (portage non officiel)	968,7 ko	2 902,0 ko	[liste des fichiers]