Paket: soapdenovo2 (242+dfsg-3) [debports]

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Assembler, der Reads zu einem de-novo-Entwurf zusammenfügt

SOAPdenovo ist eine neuartige Methode zum Zusammenfügen kurzer Reads (Sequenzfragmente), mit der ein de-novo-Entwurf für Genome in der Größenordnung des menschlichen Genoms erstellt werden kann. Das Programm wurde speziell für das Zusammenfügen kurzer Sequenzfragmente von Illumina GA entwickelt.

SOAPdenovo schafft neue Möglichkeiten Referenzsequenzen zu bauen und genaue Analysen von nicht erforschten Genomen in einer kosteneffizienten Weise durchzuführen.

Andere Pakete mit Bezug zu soapdenovo2

• dep: libc6.1 (>= 2.36)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: libunwind8

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
ia64 (inoffizielle Portierung)	968,7 kB	2.902,0 kB	[Liste der Dateien]