Paquet : diamond-aligner (2.1.11-2 et autres)

[ Paquet source : diamond-aligner  ]

aligneur de séquence locale accéléré compatible avec BLAST

DIAMOND est un aligneur de séquence pour les recherches et les séquences de protéines et d'ADN traduit conçu comme un remplacement direct des outils logiciels de NCBI BLAST. Il est utilisable pour les recherches protéine-protéine aussi bien que pour les recherches ADN-protéine portant sur des séquences courtes ou longues incluant des contigs et des assemblages, et fournit une accélération jusqu'à x 20,000 par rapport à BLAST.

Autres paquets associés à diamond-aligner

• dep: libc6 (>= 2.29) [hppa, m68k]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.30) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, hppa, ia64, m68k, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, ppc64, riscv64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [non alpha, hppa, ia64, m68k, sh4]

  dep: libstdc++6 (>= 6) [alpha, hppa, m68k, sh4]

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

• rec: med-config [non alpha, hppa, m68k, sh4]

  paquet de configuration générale de Debian Med

  rec: med-config (>= 2.1) [alpha, hppa, m68k, sh4]

Télécharger diamond-aligner

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	0.9.31-2	749,2 ko	2 181,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	2.1.11-2	2 586,2 ko	9 920,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.1.11-2	1 888,2 ko	7 560,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	0.9.31-1	545,9 ko	1 622,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	2.1.9-1	2 164,2 ko	11 059,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	0.9.31-2	706,6 ko	1 844,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	2.1.11-2	1 784,6 ko	6 536,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.1.11-2	1 886,7 ko	6 472,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.1.11-2	1 848,4 ko	4 532,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2.1.11-2	2 070,4 ko	6 592,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	0.9.32-2	840,5 ko	1 786,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	2.1.11-2	1 520,3 ko	5 519,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	2.1.11-2	2 017,1 ko	6 391,0 ko	[liste des fichiers]