Paquet : diamond-aligner (2.1.3-1)

[ Paquet source : diamond-aligner  ]

aligneur de séquence locale accéléré compatible avec BLAST

DIAMOND est un aligneur de séquence pour les recherches et les séquences de protéines et d'ADN traduit conçu comme un remplacement direct des outils logiciels de NCBI BLAST. Il est utilisable pour les recherches protéine-protéine aussi bien que pour les recherches ADN-protéine portant sur des séquences courtes ou longues incluant des contigs et des assemblages, et fournit une accélération jusqu'à x 20,000 par rapport à BLAST.

Autres paquets associés à diamond-aligner

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non amd64]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

• dep: libstdc++6 (>= 12)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

• rec: med-config

  paquet de configuration générale de Debian Med

Télécharger diamond-aligner

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	2 377,4 ko	8 919,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1 527,4 ko	4 783,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1 806,2 ko	6 270,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1 671,9 ko	6 090,0 ko	[liste des fichiers]