Paquet : python3-biopython (1.83+dfsg1-3 et autres)

[ Paquet source : python-biopython  ]

bibliothèque de Python 3 pour la bio-informatique

Le projet Biopython est une association internationale de programmeurs d'outils libres en Python pour la bio-informatique.

C'est une initiative collaborative distribuée pour le développement de bibliothèques et d'applications en Python 3 pour répondre aux besoins des travaux actuels et futurs en bio-informatique. Le code source est disponible sous la licence Biopython qui est extrêmement libérale et compatible avec presque toutes les licences au monde. Le projet travaille avec la Open Bioinformatics Foundation qui fournit généreusement au projet un espace web et CVS.

Autres paquets associés à python3-biopython

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

  gestion rapide des tableaux pour le langage Python – Python 3

• dep: python3-numpy-abi9

  paquet virtuel fourni par python3-numpy

• dep: python3-reportlab (>= 4.0.4-1~)

  bibliothèque ReportLab pour créer des documents PDF en utilisant Python3

• dep: w3c-sgml-lib

  DTD et fichiers de catalogue de w3.org

• rec: ncbi-blast+ (>= 2.10.1-3)

  suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération

• rec: python-biopython-doc (= 1.83+dfsg1-3)

  documentation pour la bibliothèque Biopython

• sug: bwa

  dispositif d'alignement Burrows-Wheeler

• sug: clustalo

  programme à usage général d'alignement de plusieurs séquences pour les protéines

• sug: clustalw

  alignement de séquences de nucléotides ou de peptides

• sug: dialign

  alignement de plusieurs séquences par segments

• sug: dssp

  assignation de la structure secondaire de la protéine basée sur la structure en 3D

• sug: emboss

  ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne

• sug: fasttree

  arbres phylogénétiques à partir d'alignements de nucléotides ou des séquences de protéines

• sug: mafft

  programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés

• sug: muscle3

  multiple alignment program of protein sequences

• sug: phylip

  paquet de programmes pour déduire les phylogénies

• sug: phyml

  estimation phylogénétique utilisant la probabilité maximale

• sug: prank

  Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences

• sug: probcons

  alignement de séquences multiples basé sur la cohérence probabiliste

• sug: python3-matplotlib

  système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab

• sug: python3-mmtf

  encodage binaire de structures biologiques – Python 3

• sug: python3-mysqldb

  interface de Python pour MySQL

• sug: python3-pil

  Python Imaging Library (Python3)

• sug: python3-psycopg2

  Python 3 module for PostgreSQL

• sug: python3-rdflib

  Python 3 library containing an RDF triple store and RDF parsers/serializers

• sug: python3-scipy

  outils scientifiques pour Python 3

• sug: python3-tk

  Tkinter –⋅écriture d'applications Tk avec Python⋅3.x

• sug: raxml

  ressemblance maximale accélérée aléatoire d'arbres phylogénétiques

• sug: samtools

  traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM

• sug: t-coffee

  alignement multiple de séquences

• sug: wise

  comparaison de biopolymères, tels les séquences d'ADN et de protéines

Télécharger python3-biopython

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
armel	1.83+dfsg1-3+b1	1 553,2 ko	11 369,0 ko	[liste des fichiers]