Paquet : arb (6.0.6-8) [non-free]

[ Paquet source : arb  ]

phylogenetic sequence analysis suite - main program

ARB is a graphical suite of tools for sequence database handling and data analysis. A central database of processed (aligned) sequences and any type of additional data linked to the sequence entries is structured according to phylogeny or other user-defined criteria.

The ARB project (from the Latin "arbor", a tree) is a joint initiative of the Lehrstuhl für Mikrobiologie and the LRR of the Technische Universität München in 1992. Since 2014 the ARB project is continued by the Department of Molecular Ecology http://www.mpi-bremen.de/en/Department_of_Molecular_Ecology.html at the Max Planck Institute for Marine Microbiology in Bremen in cooperation with Ribocon GmbH http://www.ribocon.com .

Étiquettes: Mis en œuvre en: C, Interface utilisateur: Graphical User Interface, Système X Window, Rôle: role::program, uitoolkit::motif, Boîte à outils d'interface utilisateur: Bibliothèque X, Système X Window: Application

Autres paquets associés à arb

• dep: arb-common (= 6.0.6-8)

  phylogenetic sequence analysis suite - common files

• dep: fastdnaml

  outil pour la construction d'arbres phylogénétiques de séquences d'ADN

• dep: fig2dev

  utilitaires de conversion de fichiers de figures d’Xfig

• dep: libarb (= 6.0.6-8)

  phylogenetic sequence analysis suite - libraries

• dep: libc6 (>= 2.38)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libtirpc3t64 (>= 1.0.2)

  bibliothèque RPC indépendante de la couche de transport

• dep: libxm4 (>= 2.3.3)

  Motif - X/Motif shared library

• dep: libxt6t64

  bibliothèque de la boîte à outils Intrinsics X11

• dep: mafft

  programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés

• dep: mrbayes

  Bayesian Inference of Phylogeny

• dep: openssh-client

  Client shell (SSH), pour accèder de manière sécurisée à des machines distantes

• dep: phylip

  paquet de programmes pour déduire les phylogénies

• dep: phyml

  estimation phylogénétique utilisant la probabilité maximale

• dep: raxml

  ressemblance maximale accélérée aléatoire d'arbres phylogénétiques

• dep: readseq

  conversion entre formats de séquences

• dep: tree-puzzle

  reconstruction d’arbres phylogénétiques par la vraisemblance maximale

• dep: xdg-utils

  utilitaires d'intégration au bureau de freedesktop.org

• rec: bioperl

  outils en Perl pour la bio-informatique

• rec: xfig

  outil de création interactive de dessin sous X11

• sug: arb-database

  Paquet indisponible

• sug: gnuplot

  programme de tracé interactif en ligne de commande
  un paquet virtuel est également fourni par gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• sug: gv

  Affiche sous X les fichiers PostScript et PDF (utilise les widgets athena 3D)

Télécharger arb

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	2 052,2 ko	7 759,0 ko	[liste des fichiers]