Paquet : arb (6.0.6-4) [non-free]

[ Paquet source : arb  ]

phylogenetic sequence analysis suite - main program

ARB is a graphical suite of tools for sequence database handling and data analysis. A central database of processed (aligned) sequences and any type of additional data linked to the sequence entries is structured according to phylogeny or other user-defined criteria.

The ARB project (from the Latin "arbor", a tree) is a joint initiative of the Lehrstuhl fuer Mikrobiologie http://www.mikro.biologie.tu-muenchen.de/ and the Lehrstuhl fuer Rechnertechnik und Rechnerorganisation http://wwwbode.informatik.tu-muenchen.de/ of the Technical University of Munich.

Étiquettes: Mis en œuvre en: C, Interface utilisateur: Graphical User Interface, Système X Window, Rôle: role::program, uitoolkit::motif, Boîte à outils d'interface utilisateur: Bibliothèque X, Système X Window: Application

Autres paquets associés à arb

• dep: arb-common (= 6.0.6-4)

  phylogenetic sequence analysis suite - common files

• dep: fastdnaml

  outil pour la construction d'arbres phylogénétiques de séquences d'ADN

• dep: fig2dev

  utilitaires de conversion de fichiers de figures d’Xfig

• dep: libarb (= 6.0.6-4)

  phylogenetic sequence analysis suite - libraries

• dep: libc6 (>= 2.15)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libglib2.0-0 (>= 2.12.0)

  bibliothèque GLib de routines C

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libx11-6

  Bibliothèque X11 partie client

• dep: libxext6

  bibliothèque de diverses extensions pour X11

• dep: libxm4 (>= 2.3.3)

  Motif - X/Motif shared library

• dep: libxpm4

  bibliothèque pixmap X11

• dep: libxt6

  bibliothèque de la boîte à outils Intrinsics X11

• dep: mafft

  programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés

• dep: mrbayes

  Bayesian Inference of Phylogeny

• dep: openssh-client

  Client shell (SSH), pour accèder de manière sécurisée à des machines distantes

• dep: phylip

  paquet de programmes pour déduire les phylogénies

• dep: phyml

  estimation phylogénétique utilisant la probabilité maximale

• dep: raxml

  ressemblance maximale accélérée aléatoire d'arbres phylogénétiques

• dep: readseq

  conversion entre formats de séquences

• dep: tree-puzzle

  reconstruction d’arbres phylogénétiques par la vraisemblance maximale

• dep: xdg-utils

  utilitaires d'intégration au bureau de freedesktop.org

• rec: bioperl

  outils en Perl pour la bio-informatique

• rec: xfig

  outil de création interactive de dessin sous X11

• sug: arb-database

  Paquet indisponible

• sug: gnuplot

  programme de tracé interactif en ligne de commande
  un paquet virtuel est également fourni par gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• sug: gv

  Affiche sous X les fichiers PostScript et PDF (utilise les widgets athena 3D)

Télécharger arb

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	2 016,0 ko	7 761,0 ko	[liste des fichiers]