Paquet : iva (1.0.11+ds-5) [debports]
Liens pour iva
Ressources Debian :
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Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
assemblage itératif de séquences virales
IVA est un programme d’assemblage de novo conçu pour assembler des génomes de virus n’ayant pas de séquences répétées, utilisant des paires lues par Illumina séquencées à partir de populations mélangées à une profondeur extrêmement élevée.
L’algorithme principal d’IVA fonctionne en étendant de manière itérative des contigs utilisant des paires lues alignées. Son entrée peut être simplement des paires lues ou, en outre, un ensemble de contigs existants peut être fourni pour être étendu. Alternativement, il peut prendre des lectures avec une séquence de référence.
Autres paquets associés à iva
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- dep: default-jre-headless
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Télécharger iva
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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alpha (portage non officiel) | 8 380,5 ko | 8 770,0 ko | [liste des fichiers] |