Paquet : r-bioc-scran (1.34.0+dfsg-1)

[ Paquet source : r-bioc-scran  ]

Paquet « expérimental »

Avertissement : ce paquet appartient à la distribution expérimentale. Cela signifie qu'il peut être instable ou bogué et peut éventuellement causer des pertes de données. Assurez-vous de consulter le journal des modifications (changelog) et les autres documentations existantes avant de l'utiliser.

méthodes de BioConductor pour l’analyse de données de séquençage d’ARN de cellule unique

Implements functions for low-level analyses of single-cell RNA-seq data. Methods are provided for normalization of cell-specific biases, assignment of cell cycle phase, detection of highly variable and significantly correlated genes, identification of marker genes, and other common tasks in routine single-cell analysis workflows.

Autres paquets associés à r-bioc-scran

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [non riscv64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non riscv64, sparc64]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64, sparc64]

• dep: liblapack3

  bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée

  ou liblapack.so.3

  Paquet indisponible

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: r-api-4.0

  Paquet indisponible

• dep: r-api-bioc-3.20

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-beachmat

  E/S pour plusieurs formats de stockage de données de matrice

• dep: r-bioc-biocgenerics

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-biocsingular

  décomposition en valeurs singulières pour les paquets de Bioconductor

• dep: r-bioc-bluster

  Clustering Algorithms for Bioconductor

• dep: r-bioc-delayedarray

  BioConductor delayed operations on array-like objects

• dep: r-bioc-edger

  analyse empirique de données numériques d’expressions de gène avec R

• dep: r-bioc-limma

  modèles linéaires pour des données de biopuce (microarray)

• dep: r-bioc-matrixgenerics

  S4 Generic Summary Statistic Functions that Operate on Matrix-Like Objects

• dep: r-bioc-metapod

  méta-analyse avec GNU R de valeurs-p d’analyses différentielles

• dep: r-bioc-s4arrays

  foundation of array-like containers in Bioconductor

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-scuttle

  BioConductor single-cell RNA-Seq analysis utilities

• dep: r-bioc-singlecellexperiment

  S4 Classes for Single Cell Data

• dep: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor assay container

• dep: r-cran-bh

  paquet (virtuel) de GNU R pour fournir BH

• dep: r-cran-dqrng

  GNU R fast pseudo random number generators

• dep: r-cran-igraph

  analyse et visualisation de réseau avec GNU R

• dep: r-cran-matrix

  paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• dep: r-cran-statmod

  GNU R package providing algorithms and functions for statistical modeling

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-delayedmatrixstats

  fonctions pour les lignes et les colonnes des objets « DelayedMatrix »

• sug: r-bioc-deseq2

  R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis

• sug: r-bioc-hdf5array

  HDF5 backend for DelayedArray objects

• sug: r-bioc-residualmatrix

  Creating a DelayedMatrix of Regression Residuals

• sug: r-bioc-scaledmatrix

  creating a DelayedMatrix of scaled and centered values using GNU R

• sug: r-bioc-scater

  Single-Cell Analysis Toolkit for Gene Expression Data in R

• sug: r-bioc-scrnaseq

  Collection of Public Single-Cell RNA-Seq Datasets

• sug: r-cran-dynamictreecut

  méthodes pour la détection de regroupements pour le regroupement hiérarchique

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-pheatmap

  GNU R package to create pretty heatmaps

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

Télécharger r-bioc-scran

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	993,9 ko	1 409,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	976,8 ko	1 429,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	975,1 ko	1 533,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	992,3 ko	1 560,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	989,6 ko	1 493,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	990,8 ko	1 336,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	995,2 ko	1 436,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	968,5 ko	2 076,0 ko	[liste des fichiers]