Paquet : libhts-dev (1.21+ds-0+exp2)

[ Paquet source : htslib  ]

Paquet « expérimental »

Avertissement : ce paquet appartient à la distribution expérimentale. Cela signifie qu'il peut être instable ou bogué et peut éventuellement causer des pertes de données. Assurez-vous de consulter le journal des modifications (changelog) et les autres documentations existantes avant de l'utiliser.

development files for the HTSlib

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension ‘csi’ (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

This package contains development files for the HTSlib: headers, static library, manual pages, etc.

For compatibility with sambamba, the internal routine cram_to_bam was exported, hereto adopting a patch found in guix.

Étiquettes: Développement de logiciel: Programmation C, Bibliothèques, Mis en œuvre en: C, Rôle: Bibliothèque de programmation

Autres paquets associés à libhts-dev

• dep: libbz2-dev

  Bibliothèque de compression de fichiers par tri de blocs, de haute qualité - développement

• dep: libcurl4-gnutls-dev

  fichiers de développement et documentation pour libcurl –⋅version GnuTLS

• dep: libdeflate-dev

  headers for whole-buffer compression and decompression library

• dep: libhts3t64 (= 1.21+ds-0+exp2)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma-dev

  XZ-format compression library - development files

• dep: zlib1g-dev

  bibliothèque de compression — paquet de développement

Télécharger libhts-dev

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1 694,6 ko	7 652,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1 691,8 ko	7 225,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1 618,8 ko	6 913,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1 610,5 ko	5 119,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1 615,9 ko	4 848,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1 763,7 ko	5 581,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1 686,3 ko	5 141,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1 475,5 ko	5 177,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1 713,8 ko	7 551,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1 675,9 ko	7 276,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1 726,9 ko	7 324,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	3 056,3 ko	30 975,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1 653,5 ko	6 991,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1 654,1 ko	4 988,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1 556,8 ko	7 033,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1 667,2 ko	5 647,0 ko	[liste des fichiers]