Paquet : seaview (1:4.7-1)
Liens pour seaview
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source seaview :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Charles Plessy (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [doua.prabi.fr]
Paquets similaires :
Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny
SeaView reads and writes various file formats (NEXUS, MSF, CLUSTAL, FASTA, PHYLIP, MASE, Newick) of DNA and protein sequences and of phylogenetic trees. Alignments can be manually edited. It drives the programs Muscle or Clustal Omega for multiple sequence alignment, and also allows one to use any external alignment algorithm able to read and write FASTA-formatted files. It computes phylogenetic trees by parsimony using PHYLIP's dnapars/protpars algorithm, by distance with NJ or BioNJ algorithms on a variety of evolutionary distances, or by maximum likelihood using the program PhyML 3.0. SeaView draws phylogenetic trees on screen or PostScript files, and allows one to download sequences from EMBL/GenBank/UniProt using the Internet.
Autres paquets associés à seaview
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- dep: libc6 (>= 2.7)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libfltk-images1.3
- Fast Light Toolkit - image loading support
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- dep: libfltk1.3 (>= 1.3.4)
- Fast Light Toolkit - main shared library
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- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libstdc++6 (>= 5)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Bibliothèque de compression - binaires
Télécharger seaview
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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i386 | 357,7 ko | 899,0 ko | [liste des fichiers] |