Paquet : python3-biopython (1.73+dfsg-1)

[ Paquet source : python-biopython  ]

Python library for bioinformatics (implemented in Python 3)

The Biopython Project is an international association of developers of freely available Python tools for computational molecular biology.

It is a distributed collaborative effort to develop Python libraries and applications which address the needs of current and future work in bioinformatics. The source code is made available under the Biopython License, which is extremely liberal and compatible with almost every license in the world. The project works along with the Open Bioinformatics Foundation, who generously provide web and CVS space for the project.

This package is targeting Python version 3.

Autres paquets associés à python3-biopython

• dep: libc6 (>= 2.4)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.8)

  dep: python3 (>= 3.7~)

• dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

  gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3

• dep: python3-numpy-abi9

  paquet virtuel fourni par python3-numpy

• dep: python3-reportlab

  bibliothèque ReportLab pour créer des documents PDF en utilisant Python3

• rec: ncbi-blast+

  suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération

• rec: python-biopython-doc (= 1.73+dfsg-1)

  documentation pour la bibliothèque Biopython

• sug: clustalo

  programme à usage général d'alignement de plusieurs séquences pour les protéines

• sug: clustalw

  alignement de séquences de nucléotides ou de peptides

• sug: dialign

  alignement de plusieurs séquences par segments

• sug: dssp

  affectation de la structure secondaire de la protéine basée sur la structure en 3D

• sug: emboss

  ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne

• sug: fasttree

  arbres phylogénétiques à partir d'alignements de nucléotides ou des séquences de protéines

• sug: mafft

  programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés

• sug: muscle

  Programme d'alignements multiples de séquences de protéine

• sug: phylip

  paquet de programmes pour déduire les phylogénies

• sug: phyml

  estimation phylogénétique utilisant la probabilité maximale

• sug: prank

  Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences

• sug: probcons

  alignement de séquences multiples basé sur la cohérence probabiliste

• sug: python3-matplotlib

  système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab –⋅Python⋅3

• sug: python3-mysqldb

  interface de Python pour MySQL

• sug: python3-pil

  Python Imaging Library (Python3)

• sug: python3-psycopg2

  Python 3 module for PostgreSQL

• sug: python3-rdflib

  Python 3 library containing an RDF triple store and RDF parsers/serializers

• sug: python3-renderpm

  interface Python de rendu de bas niveau

• sug: python3-scipy

  outils scientifiques pour Python 3

• sug: python3-tk

  Tkinter –⋅écriture d'applications Tk avec Python⋅3.x

• sug: raxml

  ressemblance maximale accélérée aléatoire d'arbres phylogénétiques

• sug: samtools

  traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM

• sug: t-coffee

  alignement multiple de séquences

• sug: w3-dtd-mathml

  DTD pour Mathematical Markup Language V2.0

• sug: wise (>= 2.4.1-16)

  comparaison de biopolymères, tels les séquences d'ADN et de protéines

Télécharger python3-biopython

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
i386	1 257,4 ko	8 919,0 ko	[liste des fichiers]