Paquet : murasaki (1.68.6-8 et autres)

[ Paquet source : murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Autres paquets associés à murasaki

• dep: libboost-filesystem1.67.0

  opérations sur le système de fichiers (chemins portables, itération sur des répertoires,⋅etc.) en C++

• dep: libboost-iostreams1.67.0

  bibliothèque Boost.Iostreams

• dep: libboost-regex1.67.0 (>= 1.67.0-10)

  Bibliothèque d'expressions rationnelles pour C++

• dep: libboost-system1.67.0

  bibliothèque de système d'exploitation (par ex. gestion des diagnostics)

• dep: libc6 (>= 2.3.6-6~)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libcrypto++6

  General purpose cryptographic library - shared library

• dep: libgcc1 (>= 1:4.2)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: murasaki-common

  homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Télécharger murasaki

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
i386	1.68.6-8+b1	512,8 ko	3 197,0 ko	[liste des fichiers]